Для того, чтобы уменьшить объем дискового пространства, занимаемого темплейтами виртуальных машин я решил заполнить свободное место на дисках нулями. 
В этому случае, при размещении темплейта на томе со сжатием или дедупликацией, объем занимаемого места будет минимален. 
Linux disk zeroing
Для linux все просто:
dd if=/dev/zero of=/dev/ZERO bs=16384 rm -f /dev/ZERO
Создаем файлик в который пишем нули.  
Windows Disk Zeroing
Для Windows решений несколько. 
Первое - стандатрная утилита cipher. Для этого у нее есть ключ /W.
cipher /W:c:\
Второй вариант - sdelete
sdelete -z c:
Discussion