На Windows Server 2008 R2 установлен Citrix Licensing Server версии 15.5.0.25000, который идет в комплекте с Citrix XenDesktop 7.15 LTSR CU3 (7.15.3000).
Процесс CITRIX.exe на 100% занимает одно ядро CPU.

В логах ничего подозрительного нет, за исключением странных времен событий.

Причина оказалась в тайм-зоне, установленной на сервере.
Все остальные серверы окружения (контроллер домена ActiveDirectory, Citrix Desktop Delivery Controller и прочие) настроены на таймзону UTC+3:00 Moscow, а Citrix Licensing Server был настроен на UTC-8:00 Pacific Time. В результате, в логах можно было встретить события, которые для данного сервера были бы в будущем.
После установки корректной таймзоны и перезагрузки сервера все пришло в норму.
Следите за таймзонами!